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作者:橘子博士
俗话说,一图胜千言。科研论文更是如此。
作为照片纸的门面,一定要规范,一定要“西装革履”,“衣冠楚楚”。一定不能“胡子拉碴”、“不整洁”。
可惜很多刚踏入科研大门的孟新,不知道科研论文和图片的制作规范,甚至很多好不容易熬到毕业季的老腊肉也只是半生不熟。
接下来,笔者将从一个具体的例子出发,系统的和大家聊聊规范科研论文组图的流程。
我们来看看下面的组图(图1)。这张图乍一看还行,其实很不规则。比如:图片大小不统一,线条和字体大小粗细不统一,图片模糊等。,像个小气的人。
所以,今天笔者带你修改标准,让自己符合科研论文图片的要求,成为“衣冠楚楚的职场精英”。
图1(来源:奥兰治医生)
在修改之前,我们需要了解一些基础知识:
一、基础知识
1.科研论文中图片的物理尺寸和一般要求
就像人有身高、声音等很多特征一样。,一张图片有很多属性,比如宽度、高度、像素、分辨率。
首先,我们一定要记住,我们在排版组图的时候,一定要以图片的物理尺寸为基础,即整个组图的宽度(cm)是多少,组图中每张图片的宽度(cm)是多少。
就像我们在使用Word文档的时候,一般都是按照A4纸的大小(21厘米宽,30厘米长)来写。
在科研论文的图片中,我们主要考虑宽度。由于科研论文也是按照类似A4纸的尺寸排版,A4纸21cm宽,除了两边的页边距空白色,就是能容纳图片的宽度了。
论文按宽度可分为三种:全版式,宽度约17c m;;半版式,宽约8cm宽度约为12-15厘米的2/3布局(图2)。
我们在做群图的时候,首先要确定的是上面三个群图我们要做哪个。然后,逐个处理组图中的单个图片。
图2(来源:SCI插图规范(国际通用版))
对于单张图片,也有相应的格式要求。例如,字体类型建议为Arial或Times New Roman,字号最好为6-14pt,线宽为0.25-1.5pt(具体要求请参考SCI插图规范(国际通用版))。)
2.科研论文中的两类图片
科研图片主要有两种,一种是位图,一种是矢量。
位图由像素组成。放大后可以看到像马赛克一样的小像素。常用的格式有。tiff,。jpg和。png。科研论文中的位图主要是照片,如荧光图片、组织化学图片、动物肿瘤图片等。分辨率应至少达到300像素/英寸。
矢量图由路径和锚点组成,任意放大或缩小时清晰度不变。常用的有pdf和eps。科研论文中的矢量图主要是统计图(如散点图、直方图)和模式图(如信号路径图、流程图)。如图1,图A和图B是矢量图,图C是位图。(所有能做成矢量图的建议都做成矢量图。)
根据以上两类图片,我们要用不同的软件来生成和处理。
对于位图,要尽量获取高质量的原始图像,然后在Adobe Photoshop (PS)中进行处理。至于矢量图,我们一般用矢量图软件生成,可以同时处理,比如GraphPad Prism;也可以生成并导入Adobe Illustrator(AI)进行处理。(制图排版组图不推荐PPT。)
二、科研论文图像处理和分组排版的一般流程
有了以上两个基础知识,我们就可以总结出科研论文图像处理和组排的一般流程:
1.确定布局:全布局?半布局?2/3布局?组内排列了多少张图片?从而得到单张图片的基本参数,比如宽度和高度。
2.使用PS处理位图,并将其调整到所需的大小和分辨率。仅使用图片,不要添加文字或线条。
3.在Graphpad Prism、Excel、SPSS中生成矢量统计图,然后在相应的软件中处理或导入AI。
4.用AI制作纸样图,并进行处理。
5.将处理后的单幅图片全部导入AI,在AI中添加文字和修饰,完成排版组图。
6.最后,出口。如果以位图格式导出,请选择。tiff。选择。eps如果以矢量图格式导出。
三。具体例子的演示
接下来,我们以图1为例进行详细的演示。
首先,我们确定组图片的宽度。我选择2/3布局,设置图1宽度为120mm。共有三个图形,每个图形的宽度为40毫米。然后我在画面两端和每个图形之间设置了1mm的间隙,这样画面的宽度总共是124mm。
如图3,打开AI,点击画板工具(1),新建一个画板(2),设置画板参数(3),命名为图1,宽度设置为124mm (4),左上角XY刻度设置为0(5)。然后分别在1 mm、41 mm、82 mm、123 mm处添加参考线,表示图片的宽度(6)。
图3(来源:奥兰治医生)
然后,设置图片的高度。常见荧光图像的长宽比为4: 3,所以图1(C)的高度设为3cm。由于荧光图像的高度一般与坐标轴一致,我们也将图1(A,b)的坐标轴高度设置为3cm。
接下来,我们将分别处理图片。
首先对荧光图像进行处理,修改宽度、高度和分辨率。如图4,打开PS,导入图片,点击菜单栏中的“图片(1)”,选择“图片大小(2)”,就可以看到原图的宽度、高度、分辨率(3)。此时将分辨率改为300,点击“确定”(不要勾选底部的“重采样”)。
现在图片的宽度和高度是13.55×10.16 cm。由于我们只需要4×3 cm,所以图片的大小完全足够了。
图4(来源:奥兰治医生)
然后,如图5所示,使用矩形选择功能将样式设置为固定大小,宽度和高度为4×3 cm。单击菜单栏中的“图像(1)”,然后选择“裁剪(2)”。
这个时候,我们再来检查一下“图像大小”。图像的宽度和高度变成了4× 3cm,分辨率为300(3)。我们可以出口。
图5(来源:奥兰治医生)
处理完荧光图后,我们开始处理直方图(图1(A))。这里以GraphPad Prism为例。在Graphpad Prism中做出原图后,开始调整图片样式和大小。如图6所示,打开Graphpad Prism,在View (1)菜单中选择Show Grid (2),可以清晰地显示图片的宽度和高度。
图6(来源:奥兰治医生)
然后,如图7所示,我们单击工具栏中的“更改”(1)并选择“标题和字体”(2)来调整字体类型、大小和与坐标的距离。
在“编号和标注”(3)中,点击X轴右边和Y轴左边的“字体”(4),调整为“Arial-regular-7pt”(5)。然后在距离轴,设置为0.1厘米(6)。
然后,我们选择“框架和原点”(7)来调整坐标轴的宽度和高度以及线条的粗细。在“形状、大小和位置”(8)中,我们选择“形状”作为“自定义”,自定义坐标轴的宽度和高度。我们根据荧光图像的高度将“高度”设置为“3 cm”。
这时,我们回到图片窗口,发现当“宽度”设置为“3.6 cm”时,整个图片的宽度约为4cm,是合适的。然后,在“轴和颜色”中,我们将“轴的厚度”调整为“1/2pt”(9)。
现在图片已经根据科研论文的规格进行了调整。我建议你把图片直接复制粘贴到Graphpad Prism里的AI里排版组图。
图7(来源:奥兰治医生)
接下来,我们处理流程图(图1(B))。流程图是Flowjo导出的PDF,我们直接导入AI进行处理。
这个图形处理流程的一般步骤依次是“释放剪切蒙版-调整大小-调整线条粗细-调整字体类型和大小”。(过程复杂,这里就不讨论了)。
图8(来源:奥兰治医生)
最后将处理后的三张图片导入AI。如图9所示,可以看出处理后的大小、字体类型和大小、线条粗细等。这三张照片是一致的。
接下来,使用参考线对齐它们,并添加图片编号。这样就初步完成了一个简单的群图。和图一比,是不是顺眼多了?
图9(来源:奥兰治医生)
看到这里,有些朋友可能已经晕了。综上所述,图10是科研论文排版的一般流程。朋友们只需要按照流程,理清思路,按部就班的操作,就能拥有同样规格的帅气组图!
图10(来源:橙色博士)
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