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生信技能树
本篇为学习该视频后的个人练习
如何加快压缩和解压缩的速度
- gzip/gunzip
压缩：gzip readme.txt
解压：gunzip readme.txt.gz
- zip/unzip
压缩：zip readme.txt.zip readme.txt
解压：unzip readme.txt.zip
- bzip2
压缩：bzip2 readme.txt
解压：bizp2 readme.txt.bz2
- tar（适用于多个文件）
压缩：tar -zcvf output.tar.gz file1 file2
解压：tar -zxvf input.tar.gz
这些都是单线程的
pigz这是双线程的
lscpu 看当前cpu的一些参数 讯享网
可以多线程进行压缩和解压缩
pigz的下载
conda install pigz
参数
讯享网-d --decompress 解压缩 -p --processes n 使用几个线程来解压 -k --keep 保留原文件 -c --stdout 输出到标准输出流
压缩成.gz格式
pigz -k -p 8 file1 
很快啊
压缩成.tar.gz
讯享网tar -cvf - file1 file2 file3 |pigz -p 8 > output.tar.gz
解压.gz格式的文件
pigz -d -k -p 48 SRR_mapped_and_unmapped.fastq.gz 
解压缩.tar.gz格式的文件
讯享网pigz -d -c -p 48 1.tar.gz | tar -xf -
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