2025年基因调控分析之非编码RNA

基因调控分析之非编码RNA非编码 RNA 简介 非编码 RNA ncRNA 是由基因组转录而成的不编码蛋白质的 RNA 分子 非编码 RNA 除了在转录和转录后水平上发挥作用外 还在基因表达的表观遗传学调控中发挥重要作用 在真核生物基因组中 大约 90 的基因是转录基因 在这些转录基因中只有 1 2 编码蛋白质 其他大多数转录为非编码 RNA 非编码

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​​非编码RNA简介

非编码 RNA (ncRNA) 是由基因组转录而成的不编码蛋白质的 RNA 分子。非编码 RNA 除了在转录和转录后水平上发挥作用外,还在基因表达的表观遗传学调控中发挥重要作用。在真核生物基因组中,大约 90% 的基因是转录基因,在这些转录基因中只有 1-2% 编码蛋白质,其他大多数转录为非编码RNA。非编码 RNA 可分为两种主要类型:基础结构型ncRNA和调控型ncRNA。基础结构型 ncRNA 在翻译和剪接中起着类似于管家基因的作用,包括核糖体 RNA(rRNA)、转移 RNA(tRNA) 和核内小分子 RNA(snRNA) 等种属。调控型 ncRNA 主要包括以下几类:microRNA (miRNA) ,Piwi 相互作用 RNA(piRNA),小分子干扰 RNA (siRNA),长链非编码 RNA (lncRNA)以及环状RNA(circRNA)等。

非编码RNA按照功能分类

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调控型RNA功能介绍

  1. microRNA (miRNA) : miRNA 是一类长度约为 20-24 nt 的单链小分子,来源于形成独特发夹结构的转录本,被称为 pre-miRNA,参与转录后基因表达调控。miRNA 将通过 3’UTR 与靶 mRNA 转录本上的互补序列配对,导致靶基因沉默。
  2. Piwi 相互作用 RNA(piRNA): piRNA 是小分子 ncRNA (24-31nt),能够与 Argonaute 家族的 Piwi 蛋白形成复合物。piRNA 的特点是 5’端有尿苷,3’端有 2’-O-甲基修饰。主要与PIWI亚家族成员Piwi蛋白或AGO3蛋白质结合而发挥作用。
  3. 小分子干扰 RNA (siRNA):​siRNA 是长链线性 dsRNA,被 Dicer 加工成长度为 20-24 nt 的成熟 siRNA,加载到 RISC 后指导沉默。与 miRNA 相似,它们通过被称为 RNA 干扰 (RNAi) 的过程介导转录后沉默,在该过程中,siRNA 干扰互补核苷酸序列的表达。
  4. 长链非编码 RNA (lncRNA): IncRNA是长度大于200个核苷酸的非编码RNA。研究表明, IncRNA在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,是遗传学研究热点。

参考文献

  1. Esteller M. Non-coding RNAs in human disease[J]. Nat Rev Genet. 2011 Nov 18;12(12):861-74. doi: 10.1038/nrg3074. PMID: .
  2. Mattick JS, Makunin IV. Non-coding RNA[J]. Hum Mol Genet. 2006 Apr 15;15 Spec No 1:R17-29. doi: 10.1093/hmg/ddl046. PMID: .
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