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1.氨基酸的结构特征
(1)天然蛋白质中的氨基酸都是L型(除了Gly,它没有手性碳)。
(2)相同的结构通式。
(3)不同氨基酸的侧链上有不同的R基团,R基团决定了氨基酸的性质。
(4)氨基酸是溶液中的极性分子和兼性离子,一般易溶于水。
二。氨基酸的分类
根据侧链R基团的结构分类
氨基酸分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸和杂环氨基酸。
请注意以下特征:
支链氨基酸:缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸(含β-手性碳)。
含羟基的氨基酸:丝氨酸和苏氨酸(含β-手性碳,-OH可连接糖链)。
含硫氨基酸:半胱氨酸(含巯基,活性高),蛋氨酸(可作为甲基供体)。
含苯环的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸(280nm处吸收,Trp最强)。
含咪唑基的氨基酸:组氨酸(弱碱性,接近生理pH,唯一具有缓冲能力的氨基酸)。
氨基酸:脯氨酸(刚性,易形成β-转角)。
含酰胺基的氨基酸:天冬酰胺和谷氨酰胺。
酸性氨基酸:谷氨酸(含γ-羧基)、天冬氨酸(含β-羧基)。
碱性氨基酸:精氨酸(含胍基,最碱性),赖氨酸(含ε-氨基),组氨酸。
根据侧链R基团的极性:
可分为极性R基氨基酸和非极性R基氨基酸(非极性侧链)。
根据参与蛋白质的组成:
碱性氨基酸:天然氨基酸,编码,20个常见(由61个密码子编码)+2个不常见(Sec,Pyl,特殊情况下由2个终止子编码)。
稀有氨基酸:由碱性氨基酸修饰而成。
非蛋白质氨基酸:迄今为止,已发现约150种,存在于生物体内,但不构成蛋白质,如D-氨基酸。
根据营养需求分类:
必需氨基酸、非必需氨基酸和半必需氨基酸。
特别提示:
甘氨酸是唯一不含手性碳原子的氨基酸,没有光学活性。甘氨酸的侧链介于极性和非极性之间。
三。蛋白质中氨基酸的分布
非极性氨基酸一般形成蛋白质的疏水核心,而带电荷的氨基酸和极性氨基酸位于蛋白质分子的表面。例如:
非极性氨基酸Val、Pro、Phe、Ile和Leu主要分布在分子中。
极性氨基酸Asp、Lys和His大多位于分子外;
以及疏水性低的氨基酸Ala和Gly,侧链小,可在内可在外或在角落;
不带电、极性侧链氨基酸Asn、Gln、Ser、Thr,可参与氢键作用,降低极性,可以是内部的,也可以是外部的;
含有巯基的不带电荷的极性氨基酸Cys可以参与二硫键的形成,无论是内部还是外部。
四。氨基酸名称的缩写
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