上一篇文案中我们系统介绍了细胞器基因组结构特点（凌恩生物明星产品：一文读懂细胞器基因组！）。对于细胞器基因组的研究除了可以获得基因组结构、基因构成和GC含量等基本信息以外，同时，由于叶绿体（cpDNA）和线粒体（mtDNA）的基因组保守性，开展近源物种细胞器比较基因组研究，有助于了解基因的功能，表达机理及物种进化，同时可以阐释物种进化关系及基因组的内在结构，目前已经成为细胞器基因组研究趋势。
凌恩生物全面更新比较基因组分析内容，包括基因组共线性分析、系统进化树分析、选择压力分析、叶绿体基因组IR区的扩张与收缩分析以及细胞器基因组片段交流分析等。
1、共线性分析
共线性是指遗传学中的基因连锁关系，是不同物种染色体上同源基因以相同顺序排列的现象。两个物种之间的共线性程度可以作为衡量他们之间进化距离的尺度，可以知道物种间的亲缘关系。对基因组间的局部共线性块进行相似度、重排、倒置等现象的分析可以来阐述物种演化中发生的事件。
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