GFP由238个氨基酸残基组成。GFP序列中的65-67位残基（Ser65-Tyr66-Gly67）可自发形成荧光发色基团——对羟基苯咪唑啉酮GFP的激发光谱在400nm附近有一个主激发峰，在470nm附近有一个次激发峰。发射光谱在505nm附近有一尖锐的主发射峰，在540nm附近有一肩峰GFP的化学性质相当稳定，无光漂白现象（Photobleaching），用甲醛固定和石蜡包埋亦不影响其荧光性质。在细胞生物学与分子生物学领域中，绿色荧光蛋白基因常被用作报告基因。
绿色荧光蛋白的亮度均较高，与此相反，在微观应用领域中，蓝色荧光蛋白的发射光强通常会降低。EBFP（增强型蓝色荧光蛋白）是经过几轮 wtGFP 突变而形成的。突变体(Y66H)发射峰跳过绿色直接到蓝色光谱，而随后的突变体则产生激发和发射波长分别为 380 nm 和 448 nm 。这些光谱属性令其成为EGFP 在 FRET 显微镜中的“搭档”。新发现的蓝色荧光蛋白包括Azurite、SBFP2 以及 EBFP2，这些荧光蛋白具有较高和较好的量子产率和光稳定性。Sirius 是一款接替 EBFP 的荧光蛋白，这种蛋白因其对 pH 的高耐受力（pH 3 -9 范围内均能保持稳定）而被应用，是发射波长短的荧光蛋白。
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以上资料来自小编MSQ,2023.09.25
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