2026年RNA-seq数据只有处理后的数据,能上传GEO数据库吗?

RNA-seq数据只有处理后的数据,能上传GEO数据库吗?文章要求测序数据上传数据库 想上传 GEO 数据库但是原始数据 fastq 文件找不着了 只有公司给的处理过的转成 Count 的数据 请问还能上传 GEO 数据库吗 或者有什么别的数据库能接收预处理后的数据 任何没有原始数据的文章都不应该发表 1 如果能要到原始 fastq 最好 2 要不到原始 fastq 有 clean 的 fastq 也行 3 要不到 clean 的 fastq 要 sam 或者 bam 也可以 4

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文章要求测序数据上传数据库,想上传GEO数据库但是原始数据fastq文件找不着了,只有公司给的处理过的转成Count的数据,请问还能上传GEO数据库吗,或者有什么别的数据库能接收预处理后的数据?

任何没有原始数据的文章都不应该发表。

1,如果能要到原始fastq最好;

2,要不到原始fastq,有clean的fastq也行

3,要不到clean的fastq,要sam或者bam也可以

4,实在都要不到的话,试试国内期刊,或者影响因子低的期刊,高分期刊肯定得要原始数据的。当然,如果不care的话,随便找个fastq上传也行,GEO是不查你数据真实性的,reviewer一般也不会查,但是,这总归不太好哈,不建议。

不能。

没有原始数据就意味着存在科研不严谨甚至数据造假的嫌疑,既然有处理出来的数据,那么公司肯定还有原始数据的,但凡是做生信这块的必不可能不保存原始数据,除非数据不真实

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