说到本体论，生信的同学估计第一个想到的就是基因本体论 ( Gene Ontology, GO ) 了，而基因本体论其实也是开放生物医学系统注释（Open Biomedical Ontologies (OBO)）下的一个分类项目。今天来说另外一个生物科学数据分析和数据管理本体论——EDAM - Bioscientific data analysis ontology。
背景知识
关于本体论，本体论与生物医学的一些背景知识可以参考隔壁老湿在简书的《学习笔记：本体论与生物医学》一文，或者直接阅读本文章的原文。
这里主要聊一下 EDAM - Bioscientific data analysis ontology。
EDAM 是生物医学领域研究 GO 以外的又一个例子，个人最开始是从 Galaxy Project 了解得到，EDAM 在 Galaxy 项目中主要用于解决海量生物医学工具在 Galaxy 平台面板中分类不统一，用户难以查找的难题而被纳入使用。最早在 Galaxy Release 21.09 版本中上线（参考：《Galaxy Release (v 21.09)，新的工具面板视图 - 语雀》）。
Galaxy Project - Replace tool panel sections with EDAM
简介
EDAM - Ontology of bioscientific data analysis and data management，是一个全面的本体论，包含了在生物科学数据分析和数据管理(包括计算生物学、生物信息学和生物图像信息学)中广泛存在的既定的、熟悉的概念。EDAM 包括与生命科学中的数据分析和数据管理相关的主题（topics）、操作（operations）、数据类型（types of data）和数据标识符（data identifiers）以及数据格式（data formats）。EDAM 提供了一组包含首选术语和同义词、相关术语、定义和其他信息的概念，组织成一个简单直观的层次结构，以方便使用（见下图）。
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来源：科研星球网站
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