生信入门(六)——单细胞分析(Seurat)

生信入门(六)——单细胞分析(Seurat)生信入门 六 单细胞分析 Seurat 文章目录 生信入门 六 单细胞分析 Seurat 一 数据导入 1 数据来源 2 数据导入 二 标准预处理 1 QC 和选择细胞进行进一步分析 2 规范化数据 3 识别高度可变的特征

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生信入门(六)——单细胞分析(Seurat)


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文章目录

  • 生信入门(六)——单细胞分析(Seurat)
    • 一、数据导入
      • 1、数据来源
      • 2、数据导入
    • 二、标准预处理
      • 1、QC和选择细胞进行进一步分析
      • 2、规范化数据
      • 3、识别高度可变的特征(特征选择)
      • 4、缩放数据
    • 三、主成分分析(PCA)
      • 1、线性降维
      • 2、确定数据集的“维度”
    • 四、聚类细胞
    • 五、非线性降维(UMAP/tSNE)
    • 六、寻找差异表达的特征(簇生物标志物)
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上一篇 2025-02-18 17:42
下一篇 2025-03-10 23:48

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