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利用更低分辨率的Hi-C基因组互作图谱,科学家对染色质空间结构的了解不断深入。本文主要介绍TAD这种结构,TAD全称如下
Topologically Assocaited Domain
中文译作拓扑关联结构域,是一种首先在哺乳动物细胞中发现的染色质结构单元,对应的文章发表在nature上,文章标题如下
Topological Domains in Mammalian Genomes Identified by Analysis of Chromatin Interactions
pubmed的链接如下
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC/
将Hi-C基因组互作图谱的分辨率提高到100kb以下,发现了互作图谱中出现了一些self-interaction的区域,示意如下

基因组互作图谱本质是一个对称矩阵,对角线两侧的信息是相等的。上图中只取了原始方阵中对角线一侧的信息,所以看上去是一个大的三角形

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