文章目录
- 1 介绍
- 2 名词解释
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- Co-expression network
- Module
- Connectivity
- Intramodular connectivity k I M k_{IM} kIM
- Module eigengene E
- Eigengene significance
- Module Membership k M E k_{ME} kME
- Hub gene
- Gene significance GS
- Module significance
- 3 流程
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- 3.1 数据输入、清洗、预处理
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- 3.1.1 输入表达数据
- 3.1.2 检查基因和样品是否有过多缺失值，以及异常样品
- 3.1.3 输入临床特征数据
- 3.2 一步构建共表达网络和划分模块
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- 3.2.1 筛选软阀值 β \beta β
- 3.2.2 构建网络和划分模块
- 3.3 模块与性状关联分析
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- 3.3.1 量化模块特征关联
- 3.3.2 基因与性状和重要模块的关系：基因重要性和模块成员
- 3.3.3 模内分析：鉴定具有高GS和MM的基因
- 4 总结
- 参考资料
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