文章目录
- 一、 ATAC-seq原理和基础知识
-
- 1. ATAC-seq原理
- 2. Tn5转座子
-
- 1. 转座概念
- 2. 参与分子
-
- 1. 转座子
-
- （1） 简化的转座子结构
- （2） Tn5转座子的结构
- 2. 转座酶
- 3. 转座过程
- 3. fastq文件格式
- 4. shell获取文件每行长度
- 5. shell 字符串的匹配
- 二、数据比对和过滤
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- 1. 比对
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- 1. hisat2
ATAC-seq 数据分析实战
ATAC-seq 数据分析实战文章目录 一 ATAC seq 原理和基础知识 1 ATAC seq 原理 2 Tn5 转座子 1 转座概念 2 参与分子 1 转座子 1 简化的转座子结构 2 Tn5 转座子的结构 2 转座酶 3 转座过程 3 fastq 文件格式 4 shell 获取文件每行长度 5 shell 字符串的匹配
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