2025年色彩 - R 语言中的渐变色- viridis 包(色盲友好的颜色包)

科技前沿 • 2025-02-25 14:25 • 阅读 54

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viridis [ˈvɪrɪˌdɪs] n.翠绿色;

该包提供了一系列色盲友好的颜色。
Robust to colorblindness, so that the above properties hold true for people with common forms of colorblindness, as well as in grey scale printing, and
Pretty, oh so pretty

install.packages("viridis")

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1.生成颜色实例: 参数类似

讯享网library(viridis) #c1=viridis(n=10, alpha = 1, begin = 0, end = 1, direction = 1); c1 c1=viridis(10, alpha = 1, begin = 0, end = 1, direction = 1, option = "A"); c1 # n 色彩个数 # alpha 不透明度，1表示完全不透明，0表示完全透明。 # begin 和 end 表示 hue 开始和结束的位置[0,1] # direction 颜色方向，1从深到浅，-1反之。 # option 表示8种颜色方案，可以换前面的函数名，也可以换 option 种的字母A-H barplot( rep(1, length(c1)), col=c1, border=NA, yaxt='n', space=0, main="")

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2.官方教程

library(ggplot2) ggplot(data.frame(x = rnorm(10000), y = rnorm(10000)), aes(x = x, y = y)) + geom_hex() + coord_fixed() + scale_fill_viridis() + theme_bw()

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3.查看8种颜色方案

讯享网draw=function(colorname, title="", n=100){ if(title==""){ title=paste0(colorname, ", n=", n) } #print(title) cols=do.call(colorname, list(n, alpha = 1, begin = 0, end = 1, direction = -1) ) barplot( rep(1, length(cols)), col=cols, border=NA, yaxt='n', space=0, main=title) } par(mfrow=c(8,2), mar=c(0,0,1.5,0) ) for(i in c("viridis", "magma", "inferno", "plasma", "cividis", "rocket", "mako", "turbo")){ print(i) draw(i, n=10) draw(i, n=100) }

8种渐变色

4.热图

前7种渐变色都特别适合热图。

set.seed(2022) test = matrix(rnorm(200), 20, 10) test[1:10, seq(1, 10, 2)] = test[1:10, seq(1, 10, 2)] + 3 test[11:20, seq(2, 10, 2)] = test[11:20, seq(2, 10, 2)] + 2 test[15:20, seq(2, 10, 2)] = test[15:20, seq(2, 10, 2)] + 4 colnames(test) = paste("Test", 1:10, sep = "") rownames(test) = paste("Gene", 1:20, sep = "") # dim(test) # Draw heatmaps library(pheatmap) pheatmap(test)

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讯享网# viridis pheatmap(test, color = viridis(8), main="viridis")

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# mako pheatmap(test, color = viridis(8, option = "G"), main="mako")

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https://cran.r-project.org/web/packages/viridis/vignettes/intro-to-viridis.html

== End ==

2025年色彩 - R 语言中的渐变色- viridis 包(色盲友好的颜色包)

1.生成颜色实例: 参数类似

2.官方教程

3.查看8种颜色方案

4.热图

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