这篇文章是我发现canu输出的contig可能存在misassembly(错误组装), 为了探索这种错误是如何产生的，我尝试解决如下问题
- Canu输出contig的基本步骤
- contig和GFA是什么关系
- 如何提取contig对应的read
- 如何检查contig的graph
contig的构建过程
Canu的流程分为三个步骤，前两步是原始输入的纠错，最后一步是基于纠错后的reads来构建contigs。
步骤三的流程图
2025年Canu的graph和contig生成过程
Canu的graph和contig生成过程这篇文章是我发现 canu 输出的 contig 可能存在 misassembly 错误组装 为了探索这种错误是如何产生的 我尝试解决如下问题 Canu 输出 contig 的基本步骤 contig 和 GFA 是什么关系 如何提取 contig 对应的 read 如何检查 contig 的 graph contig 的构建过程 Canu 的流程分为三个步骤
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